原為南北朝十六國后秦姚興的"逍遙園"故址、西域高僧鳩摩羅什譯經(jīng)之地，是我國首創(chuàng)翻譯佛經(jīng)的國立譯坊。寺曾用名"棲禪寺"，后改稱"草堂寺"，這是由于當(dāng)時(shí)全國各地高僧云集于逍遙園，姚興便在園內(nèi)設(shè)寺，寺內(nèi)臨時(shí)構(gòu)筑一堂，權(quán)以草苔覆頂，草堂寺由此得名。據(jù)記載，鳩摩羅什在逍遙園內(nèi)與弟子翻譯的經(jīng)典計(jì)97部凡425卷，其中包括《中論》、《百論》和《十二門論》等"三論"。經(jīng)道生、僧肇等人對(duì)它們的大力弘傳，形成了早期的三論宗，故草堂寺遂成為三論宗最早的開山祖庭。鳩摩羅什入寂于后秦弘始十五年(413)，并葬于草堂寺，建塔一座，名為"鳩摩羅什舍利塔"，此塔尚存寺內(nèi)。

　　 魏末周初，大寺一分為四，草堂寺即其一。唐初，草堂寺荒蕪。天寶初年，飛錫法師住寺弘揚(yáng)凈土。唐憲宗元和年間，圭峰宗密禪師住持草堂寺，大振宗風(fēng)，中興草堂。唐末寺毀。宋乾德四年(966)改為清涼建福院。金明昌四年(1193)辨正大師增修講所，梁棟宏麗，楹檐寬敞，復(fù)稱草堂寺，曾作亭覆護(hù)羅什舍利塔。元代，皇太子五年內(nèi)曾四度下旨對(duì)寺進(jìn)行大規(guī)模修葺，逍遙園、棲禪寺、草堂寺之名并用。清雍正十二年(1734)，羅什門人僧肇被封為"大智圓正圣僧"，易名圣恩寺，然民間仍然以"草堂"為寺名。同治以后，寺宇全毀，現(xiàn)建筑為后來所修。寺內(nèi)有正殿五間，內(nèi)供如來佛，佛像前放鳩摩羅什楠木座像一尊，高1.9米，高鼻深目，神態(tài)端莊，穩(wěn)坐蓮臺(tái)，凝望遠(yuǎn)方，再現(xiàn)生前講經(jīng)念佛風(fēng)姿。寺院南邊有12間碑廊，墻上嵌以歷代名人、學(xué)者游草堂寺書寫的詩詞和重修草堂寺的碑文21塊。鐘樓一間，置放明鐘一口，鼓樓一間，內(nèi)豎《禪師傳法碑》，元代至正十二年(1352)建的敕封大智圓正圣禪師僧肇碑；唐太宗贊羅什法師詩碑和歷代文人游寺題詩碑記等。