水城歷史悠久。秦始皇二十六年(公元前221年)建漢陽縣，今水城縣境，屬漢陽縣所轄。明屬水西宣慰司轄地，水西分中水、下水、底水三部，底水即今縣境地。清康熙時屬大定府。清雍正十年(1732)，在底水之下鐘山西麓建土城。壞城皆水，故名水城，全城如荷葉浮水面，又稱荷城。雍正十一年(1732)，為開采、轉(zhuǎn)運(yùn)黑鉛，建水城廳，設(shè)通判。民國2年9月12日，水城廳改為水城縣，設(shè)縣公署。
　　1949年12月18日，水城縣和平解放，隸屬畢節(jié)專區(qū)。1970年12月，水城縣與水城特區(qū)合并為水城特區(qū)，駐地黃土坡，行使縣級職權(quán)，隸屬六盤水地區(qū)。1978年12月，隸屬六盤水市。1987年12月，國務(wù)院決定撤銷水城特區(qū)，分設(shè)水城縣和六盤水市鐘山區(qū)，1988年3月9日，水城縣正式分設(shè)，駐黃土坡。2003年10月，縣城駐地由黃土坡搬遷濫壩鎮(zhèn)雙水，即今雙水新區(qū)，位于六盤水市市區(qū)東部。